Excavada en arenisca arcillosa a 100 metros sobre el río, consiste en un laberinto de dos niveles de viviendas cueva conectadas por un largo corredor-galería con una bóveda semicilíndrica. Las cuevas se extienden hasta 37 metros de profundidad.
Solo hay una entrada a la ciudad subterránea. De ahí el nombre del monumento: Yekedeshik (que significa "una abertura" en turcomano). Tener una sola entrada probablemente hacía que las cuevas fueran invisibles y prácticamente impenetrables.
Estas cuevas están poco estudiadas y se desconoce su origen, pero los científicos especulan que Ekedeshik apareció alrededor del siglo I a. C. Esta cueva se menciona en numerosos cuentos y leyendas turcomanas. Algunos afirman que las caravanas de camellos podían entrar y salir de la cueva en dos filas. Según una leyenda, la cueva fue excavada por los guerreros de Alejandro Magno, quien llegó al territorio del actual Turkmenistán en el año 334 a. C.; otra afirma que es la creación natural de poderosos genios. La mayoría de los arqueólogos asumen que Ekedeshik era un monasterio subterráneo para monjes cristianos o budistas que vivieron en Asia Central en la antigüedad.
En total, la ciudad cueva contiene 44 habitaciones separadas. Treinta y cinco de ellas son accesibles, pero varias se han derrumbado por completo. En algunos lugares, hay pequeñas cámaras con fosos circulares, ya sean pozos rellenos o almacenes. Algunas habitaciones tienen escaleras altas que conducen al segundo piso. Las cuevas están completamente excavadas; no se utilizaron materiales de construcción. Se construyeron estanterías en las paredes de algunas "casas".
Por cierto, según los científicos, algunas cuevas se construyeron mucho más tarde, en los siglos XIV y XV. Son bastante espaciosas y podían albergar a varias personas, incluso familias enteras. Una de las cámaras de la cueva tenía claramente un propósito especial: su entrada está marcada por una estructura similar a un portal, y la decoración interior es particularmente meticulosa.
El complejo subterráneo consta de dos plantas. La planta superior, a juzgar por los artefactos encontrados durante las excavaciones, albergaba espacios de vivienda y oración, salas comunes y una cocina. La planta baja albergaba almacenes, pozos y un sistema de drenaje natural que recogía el agua subterránea acumulada en las cuevas.
Gracias a las paredes corrugadas, el sonido se absorbe por completo en Yekedishek. En las paredes hay huecos para lámparas. Aún no está claro cómo se solucionó el problema de ventilación en estas celdas. Lo que sí es cierto es que las cuevas conservaban la frescura en el calor del verano y el calor de las chimeneas en el frío del invierno. Desde la estrecha plataforma situada frente a la entrada a las catacumbas, se abre una panorámica panorámica de los alrededores: desde esta altura, con buen tiempo, se puede contemplar toda la zona a decenas de kilómetros. Hoy en día, Yekedishek es una Reserva Histórica y Cultural Estatal de Turkmenistán y una de las atracciones turísticas más populares del país. Aunque aún se realizan excavaciones arqueológicas, el sitio está abierto al turismo: se ha construido un camino hasta el punto de ascenso, el complejo cuenta con iluminación eléctrica y el suelo está cubierto de juncos para evitar que los pasos levanten polvo. Guías turísticos experimentados también trabajan en el complejo de cuevas.

